Ogni profilo WhatsApp viene sincronizzato con l'elenco dei contatti del dispositivo (smartphone, PC o tablet) su cui è installato. Questo viene fatto per trasferire l'elenco dei contatti all'applicazione e facilitare il processo di comunicazione. A sua volta, l'account WhatsApp trasferisce la copia di backup sul server per salvare ulteriormente i dati. Questi dati possono essere richiesti per un ulteriore trasferimento dell'account o per la modifica del numero di telefono.
WhaSpy utilizza la vulnerabilità SS7 per intercettare un pacchetto di dati in entrata con un codice QR. A questo punto, l'applicazione trasferisce un account nella Dashboard, dove si trovano tutte le informazioni della copia di backup. Le informazioni sono ordinate in sezioni per facilitare la visualizzazione sulla Dashboard. È inoltre possibile scaricare l'archivio sul disco rigido del dispositivo per ulteriori ricerche ed elaborazioni.